サンディエゴスーパーコンピュータセンターとSingAREN、アジア研究者のデータアクセスを改善するための努力

世界中のトラフィックの約半分 rcsb.org [the research-focused web portal of the RCSB PDB, which operates the U.S. data center of the Worldwide PDB (wwPDB) partnership]アジアとオセアニアに由来 – RCSB PDBの取締役/チーフ調査官、Stephen K. Burleyによると、この地域のデータアクセスに対する大きな需要が強調されています。

Burley氏は、「シンガポールにRCSB.orgデータキャッシュをデプロイすることで、データへの高速アクセス、データ配信の簡素化、米国サーバーの輻輳を軽減し、地域の研究者に役立ちます」と述べた。 「キャッシュは、日本大阪（Protein Data Bank Japan）、中国上海（Protein Data Bank China）、英国Hinxton（ヨーロッパのタンパク質データバンク）にあるwwPDBデータセンターが提供するデータ配信を補完する予定です」と付け加えました。 。 バリー。

SDSCでPDBサイトを管理するJose Duarteは、次のように述べています。 RutgersとSDSCの海岸。 新しいシンガポールの構築により容量が追加され、アジアおよびグローバル生物医学研究コミュニティのデータアクセス待ち時間が短縮され、効率が向上します。

SDSCとSingARENによると、MOUの署名はパートナーシップにおける重要な進展を意味し、技術を通じて科学的発見を進めるために科学界を支援するという共同の約束を強調しています。

パートナー紹介：

サンディエゴスーパーコンピュータセンター（SDSC） ~から カリフォルニア大学サンディエゴ 高性能およびデータ集約型コンピューティングおよびサイバーインフラストラクチャのリーダーです。 SDSCは、産業や学界を含む地域、地域、国の研究コミュニティにリソース、サービス、専門知識を提供し、さまざまな分野にわたる数百の総合プログラムをサポートしています。 1985年に国立科学財団（National Science Foundation）の支援を受けて設立されたSDSCは、米国初のスーパーコンピュータセンターの1つでした。 SDSCの歴史には、大規模なデータ管理、予測分析、医療ITサービス、ワークフローの自動化、インターネット分析など、複数のCenter of Excellenceが登場したデータストレージとクラウドコンピューティングの先駆的な進歩が含まれます。 詳しくは以下をご覧ください。 www.sdsc.edu。

SingAREN シンガポールの国立研究・教育（R&E）ネットワークであり、シンガポールのR&Eコミュニティサービスを専門とする地域および国際ネットワークの唯一のプロバイダです。 SingARENは、科学研究のために国内および国際的に大規模なデータセットの高速転送を促進し、弾力性のあるリンクと高速光ファイバネットワークを介して高度なネットワーク技術のデモンストレーションを可能にします。 SingAREN Open Exchange（SOE）は、シンガポールのR&Eコミュニティをアジア、オーストラリア、ヨーロッパ、アメリカを含む他の国のR&Eネットワークに接続します。 詳細については、以下を参照してください。 www.singaren.net.sg。

タンパク質データバンク は現在実験的に決定された200,000以上のタンパク質、DNAおよびRNAの3D構造を保管しており、使用制限なく自由に使用できます。 アーカイブは、米国、ヨーロッパ、アジアのデータセンターを含むWorldwide Protein Data Bankパートナーシップで共同管理しています。 米国のデータセンターは、R​​utgersのRCSB PDB、カリフォルニア大学カリフォルニア州サンディエゴのサンディエゴスーパーコンピュータセンター、UCサンフランシスコが運営しています。 RCSB PDBのコアオペレーションは 国立科学財団 (DBI-1832184)、 米国エネルギー省 (DE-SC0019749)と 国立がん研究所、 国立アレルギーおよび感染症研究所そして 国立総合医学研究所 の 国立保健院 （交付金番号R01GM133198）。