オークリッジ国立研究所の研究チームがスーパーコンピュータサミットを使用した遺伝子解析により、新型コロナウイルス感染(COVID-19)が、人体に致命的なダメージを与えるメカニズムを新たに発見したと報告した。
RASパラメータブラキニン嵐に関するCOVID-19の機械論的モデルと治療的介入| eLife
https://elifesciences.org/articles/59177
電算遺伝子研究、COVID-19の炎症反応の新しいパス提示| ORNL
https://www.ornl.gov/news/computational-gene-study-suggests-new-pathway-covid-19-inflammatory-response
スーパーコンピュータのCovid-19の分析は、ウイルスを理解するための新しい方法を提示します| 元素のような
https://elemental.medium.com/a-supercomputer-analyzed-covid-19-and-an-interesting-new-theory-has-emerged-31cb8eba9d63
世界的に猛威を振るっているCOVID-19についてIBM・Amazon・Google・Microsoftなどの主要IT企業が集まって「米国のスーパーコンピューティング・リソースを解放」と述べた各社が保有する設備や機器を研究するのに役立ち表明しています。
IBM・Amazon・Google・Microsoftが政府と協力して、新型コロナウイルスの研究に330ペタFLOPSもの処理能力を提供する – GIGAZINE
IBMのPOWER9プロセッサを搭載したサミットもCOVID-19の研究に投入されたスーパーコンピュータの一つです。 Summitを所有している米国オークリッジ国立研究所のダンジェイコブソン氏が率いる研究チームは、1万7000人から提供された4万件以上の遺伝子データをSummit分析し、遺伝子配列とCOVID-19症状の関係を調査した。
毎秒20京回の計算が可能であり、日本のFuyueに次いで世界第2位の演算能力を誇るSummitにも25億組みも遺伝子の組み合わせを検証する1週間がかかったとのこと。
Summitを使用した分析の結果COVID-19の患者肺胞細胞は、ブラ保ちニンという物質に関連する遺伝子が過剰発現していることを発見した。 また、COVID-19患者の遺伝子は、ブラ保ちニンの作用を抑制するアンジオテンシン変換酵素(エース)の発現が少ないこともわかりました。
ブラ保ちニンは、血管を拡張させ、血圧を降下させる作用がある物質であるが、過剰になると、血管透過性が増加して体液が血管から漏れやすくなります。 COVID-19患者は、肺に体液が染み出し、炎症や呼吸困難の原因になったり、つま先など水疱と像に似た “(PDFファイル)COVIDつま先(COVID toe)」という皮膚症状が発生することが知られているが、これらは過剰なブラ保ち叩い原因」ブラ保ちニンストーム」に説明がされているとのこと。
ブラ保ちニンストームに加えて、筋肉痛、疲労、吐き気、嘔吐、下痢、頭痛、認知機能の低下などCOVID-19患者で見ることができる、さまざまな症状を説明することができます。 また、これらの症状は、すでにブラ保ちニンが原因であることが知られている遺伝性血管浮腫症状と一致します。
これまでの研究では、COVID-19は、免疫の過剰反応である “サイトカインストーム「このCOVID-19の重症化と関連があるという説が唱えていますしかし、ジェイコブソン氏は、今回の研究結果から、「ブラ保ちニンストーム」がCOVID-19の症状の原因となっている「ブラ保ちニン仮説」を新たに提唱しています。
研究チームの調査によると、今回確認されたメカニズムに作用する既存の薬物治療は、少なくとも10種類あること。 研究チームは、論文で、「今回の研究結果は、ブラ保ちニンの生産を減らす薬などを中心とした予防と治療がCOVID-19との戦いで助けになる可能性を示唆している」と結論付けています。
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